Stefano Celli è entrato in magistratura nel 1991.
Nel corso degli anni ha svolto funzioni di pretore penale e del lavoro, nonché di giudice penale e Gip a Forlì; di giudice penale, Gip e giudice delegato per le misure di prevenzione a Trapani; nonché di sostituto procuratore prima a Pesaro e poi a Rimini, dove tuttora presta servizio.
Ha ricoperto l’incarico di referente per la formazione decentrata per il distretto di Ancona dal 2004 al 2008 e a Rimini ha svolto le funzioni di magistrato referente per l’informatica.
Ha curato la parte relativa alle sanzioni di un commentario per articolo al c.d. Decreto Ronchi e ha svolto relazioni in convegni e lezioni presso Scuola di specializzazione dell’Università di Urbino, prevalentemente in tema di gestione dei rifiuti e urbanistica.
E’ componente del Comitato di redazione della Rivista “La Magistratura”.